No nosso centro efetuamos a monotorização a longo prazo da biodiversidade e dos parâmetros ambientais em habitats importantes (estuários, lagoas, águas costeiras) e Áreas Marinhas Protegidas (AMPs). Estes estudos, que se encontram em desenvolvimento, são essenciais para avaliarmos as mudanças na distribuição e número das espécies, os efeitos das alterações ambientais globais e a eficácia das AMPs.