Organização
O CCMAR é uma organização de investigação independente e sem fins lucrativos inserida no sistema da Universidade do Algarve. Tem como parceiro estratégico o Instituto Português do Mar e da Atmosfera (IPMA) e, em conjunto com o Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental (CIIMAR), constitui o Laboratório Associado CIMAR.
Governança
Assembleia Geral
Presidente: Leonor Cancela
Secretário: sem nomeação Universidade do Algarve
Adelino Canário
Maria Teresa Dinis
Maria Margarida Castro
Karim Erzini
Rui Santos
João Varela
Pedro Rodrigues
Margarida Cristo
Jorge Gonçalves
Deborah Power
Conselho Fiscal
Presidente: Vítor Almeida
Vogal: Margarida Castro
Vogal: nomeado pela UALG
Direcção
Presidente: Adelino Canário
Vogal: Ana Grenha
Vogal: Elsa Cabrita
Vogal: Jorge Gonçalves
Vogal: Jorge Martins
Comissão de Aconselhamento
John Roff: Acadia University, Canada
William Fenical: Scripps Institution of Oceanography, University of California, San Diego, USA
Hans-Otto Portner: Alfred-Wegener Institute, Bremerhaven, Germany
Carlos M. Duarte: King Abdullah University of Science and Technology, Kingdom of Saudi Arabia
Vincent Laudet: Observatorie Oceanlogique de Banyuls-ser-mer Laboratoire Arago SU - CNRS, France
Tamara Galloway: University of Exeter, United Kingdom
E. Virginia Armburst: School of Oceanography, University of Washington, USA